《宝可梦大集结》作为一款全新的宝可梦对战游戏，系统简明又不失深度，同时还会考验玩家之间的团队配合与策略抉择。在地图上打倒野生宝可梦后即可得到分数。将收集到的分数带往对方得分点，即可加算为自己队伍的得分。 本作采取5对5的对战方式，主打团队策略得分，玩家通过捕获野生宝可梦并护送到得分点即可获得积分，积分更多的一方将获得比赛胜利。 游戏玩法方面，在选出角色之后，宝可梦均为基础形态，但可以通过升级来完成进化，同时，虽然本作取消了属性相克的设定，但每只宝可梦都各有其特色的技能，符合宝可梦本传游戏当中的设定，同时添加了集结技能这个终极技能。