故事围绕着主人公晴明展开，在平安时代的京都，风光旖旎，却暗流涌动—魑魅魍魉伺机而动，阳界秩序岌岌可危。幸而，世间存在着一群被称之为「阴阳师」的异能者—也就是玩家将扮演的「游戏主角」。这群异能者不但懂得观星测位、画符念咒，还可跨越阴阳两界，支配式神。为消除天、地、人、鬼之间的矛盾，阴阳师们调查一切奇异事件，维系着阴阳两界的平衡，同时也探寻着自身的过往⋯ 风光绚丽的京都画卷慢慢展开，精彩跌宕的百鬼绮谭也就此拉开了帷幕⋯