宠物召唤师真实还原了主人公立志成为神奇宝贝大师，和小精灵一起踏上旅途。一路上，主人公邂逅了不少同伴、劲敌、好友，和他们展开了一次又一次冒险。通过一次又一次的难关，不断成长，成为小精灵大师。