玩家控制一个名为“Anon”（anonymous 的缩写）的系统监控程序—Flynn 拥有的一个安全程序，用于调查 Tron 世界的阴谋。 Neon Motor cross Racing 是电影 Legacy: Tron 的前身，也是漫画小说 Trons: Betrayal 和 Nintend Wii 和 DS 版本的续集， 游戏 - 战斗网格。它被设计成 Trons 故事的一个组成部分， 具有两部电影中的某些角色和设置。 游戏以凯文弗林的视频片段开始，他正在讨论 ISO（同构算法）的存在， 在网格上自发出现的一组具有一定自由意志的程序， 并且不喜欢基本程序。 ISO 的领导人之一杰伦最近去世了，弗林怀疑这起谋杀是由 Clu 组织的，这是第一部电影中原始程序的第二个版本。 Flynn 让 Anon 尝试控制系统。 ISO 的领导者 Radia 正在参加一个正式的仪式，让她和 Clu 一起成为系统管理员。 Trons 要求 Anon 守卫仪式，但发现一个可疑的女性 Quorra，她试图通过守卫说话，而 Anon 跟着她。 仪式被病毒程序 Abraxas 猛烈破坏，但 Anon 介入并与他作战，损坏了 Abraxas 的身份光盘并迫使病毒逃离。 Clu 贬低了新 ISO 的“缺陷”。 Trons 建议弗林为了自己的安全离开网格。 在与受 Abraxas 启发的腐败的战斗中，Anon 看到 Flynn 和 Trons 被 Clu 和他的警卫伏击并杀死。 监视器发现了同样目睹了杀戮的女性 Quorra。 他们在一家作为 ISO 避风港的夜总会拜访 Zuse。 Zuse 给了他们 Solar-Sailer 访问代码，并建议他们警告 Radia，因为 ISO 会相信她的话。 当他们离开夜店时，连接它和地面的电梯斜坡被震碎，夜店里的人被困住了。 当他们前往 t在太阳帆船站，他们看到几组 ISO 被恐吓，他们意识到 Clu 已经向 ISO 宣战。 Neon Motor cross Racing 解释了导致凯文弗林被监禁在网格内的事件， 以及讲述网格多年来如何演变