《忍3》的核心玩法为2D横版跑酷，这一玩法本身并不稀奇，早在十年前便有《天天酷跑》等一众相同类型的游戏如日中天。但随着硬件技术的进步，新的游戏（如MOBA、MMORPG）不断丰富玩法和设计，而横版跑酷则受限于玩法难以创新，致使往昔红极一时的跑酷游戏纷纷跌落神坛，逐渐无人问津。如何在玩法上做到创新，是《忍3》的破局之道： ①  加入角色血条。以往的跑酷游戏基本都是“1血”设计，即触碰障碍物就宣告结束，玩家只能通过花钱购买复活次数才能继续。血条的加入提高了玩家游戏过程的容错率，同时也方便了游戏关卡在复杂性和难度上做提升，是其他玩法创新的基础，增加了横版跑酷的游戏性 ②  更多元的游戏目标。区别于以往跑酷游戏的躲避障碍与吃金币，《忍3》弱化了金币/银币的重要性，增加了躲避障碍与攻击、破坏障碍物与杂兵、击杀BOSS等游戏目标，令玩家能够在横版跑酷中找到更为丰富的游戏体验 ③  引入角色忍术、武器技能与可拾取技能球等攻击手段。既然有了敌人和BOSS，相应地就要求玩家要有攻击手段，对此《忍3》引入了忍术、武器技能与技能球等设计，令玩家可以通过合理释放技能击败敌人而获得快感，毫无疑问融合了攻击方式的跑酷相比于纯粹的跑酷更能刺激玩家的爽点 ④  更加复杂的关卡设计，提高了玩家的操作要求，增加了游戏可玩性 ⑤  更加丰富的游戏模式，防止长期单一玩法给玩家带来枯燥体验